Antibiotic resistance: Microbiological profile of urinary tract infections in Mexico

Abstract

Abstract Objective: The objective of this study was to describe the prevalence, microbiological profile, bacterial resistance, and the sensitivity to antibiotics of microorganisms causing urinary tract infection (UTI) at a single-site tertiary referral hospital in the western region of Mexico. Methods: A total of 5895 culture samples processed at the microbiology laboratory from August 1, 2014, to July 31, 2015, were analyzed. Results: A total of 5895 samples for urine cultures (UC) were collected, of which 3363 were taken in women (57.05%) and 2532 in men (42.95%). A prevalence of 24% was calculated. From 1444 positive UC, 1512 microorganisms were isolated; the major etiological agent was Escherichia coli, representing 67.28% followed by Pseudomonas with 7.12%. With respect to fungi, Candida glabrata was found as the most common agent. Susceptibility to daptomycin and linezolid was 100%, and meropenem, 91.4%. Highest antimicrobial resistance was found for ampicillin (77.47%) and moxifloxacin (72.89%). Nearly 49% of E. coli strains and 27% of Klebsiella pneumoniae strains showed extended-spectrum beta-lactamase (ESBL) production. Conclusions: Bacterial UTI persists as one of the most common infections affecting all age groups and both genders. As in other countries, E. coli ranks first in Mexico, with 67.28%, and nearly 50% of the strains produce ESBL. Resumen Objetivo: Describir la prevalencia, el perfil microbiológico, la resistencia y la sensibilidad a los antibióticos de microorganismos causantes de infecciones de vías urinarias en un centro de referencia de tercer nivel en el occidente de México. Método: Se realizó un estudio transversal que incluyó 5895 urocultivos procesados en el laboratorio de microbiología del 1 de agosto de 2014 al 31 de julio de 2015. Resultados: De los 5895 urocultivos, 3363 correspondieron a mujeres (57.05%) y 2532 a varones (42.95%). De los 1444 resultados positivos, se aislaron 1512 microorganismos (prevalencia del 24%); el más común fue Escherichia coli, con un 67.28%, seguido por Pseudomonas con un 7.12%. Candida glabrata se reportó como el patógeno fúngico más frecuente. De manera general, la sensibilidad a la daptomicina y al linezolid fue del 100%, y al meropenem fue del 91.4%. La resistencia más alta se reportó para ampicilina y moxifloxacino (77.47 y 72.89%, respetivamente). Cerca del 49% y del 27% de las cepas de E. coli y Klebsiella pneumoniae mostraron producción de betalactamasas de espectro extendido. Conclusiones: Las infecciones de vías urinarias persisten como una de las formas más habituales de infección y afectan a todos los grupos de edad. En México, al igual que en otros países, E. coli se coloca en primer lugar de frecuencia, con el 67.28%.